Zu den wesentlichen Aufgaben der Spitalhygiene zählt die Überwachung und Verhinderung von im Spital erworbenen Infektionen und multiresistenten Keimen bei Patientinnen und Patienten, Personal und Besuchern.

Im Rahmen ihrer Tätigkeit erstellt die Spitalhygiene Richtlinien, vermittelt deren Inhalte und unterstützt alle Bereiche bei der Umsetzung der infektionspräventiven Massnahmen.

Die Spitalhygiene des Spitalverbundes Appenzell Ausserrhoden ist Mitglied des Hygieneverbunds Ostschweiz (HVO) mit dem Ziel der Vereinheitlichung der hygienischen Massnahmen in der Ostschweiz.